Hugo Eugenio Pratt nasce il 15 giugno del 1927 a Rimini, figlio di un militare di carriera romagnolo di origini inglesi, Rolando Pratt, e della figlia del poeta veneziano Eugenio Genero, Evelina.
Dopo avere perso nel 1942 il padre, che era stato catturato in Africa orientale ed era morto in un campo di concentramento francese, dove lo stesso Hugo Pratt si era trasferito per qualche anno, rientra in Italia grazie all'intervento della Croce Rossa a favore dei prigionieri.